مطالعات کیوسار سه بعدی و جستجوی فارماکوفوری برخی از ترکیبات شیمیایی به عنوان عوامل ضد سرطان
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Place of Publication, Distribution, etc.
تهران
PHYSICAL DESCRIPTION
Other Physical Details
۴۲۱ص.
NOTES PERTAINING TO TITLE AND STATEMENT OF RESPONSIBILITY
Text of Note
جهانبخش قاسمی؛ فرشته شیری
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Body granting the degree
صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی
Date of degree
۱۳۹۳
Discipline of degree
شیمی
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
در این پایان نامه، مطالعات روابط کمی ساختار فعالیت (کیوسار) سه بعدی، الحاق مولکولی، غربالگری مجازی و TEMDA برای دو سری از بازدارنده های پلیمریزاسیون توبولین در نقش عوامل ضدسرطانی به منظور پیش بینی فعالیت زیستی بالقوه ترکیبات و پیشنهاد ترکیبات با خواص ضدسرطانی قویتر انجام شدند. در مطالعه اول، مطالعات کیوسار سه بعدی کومفا و کومسیا و الحاق مولکولی برای مشتقات ارتو آریل کالکون با فعالیت ضدسرطانی روده بزرگ انجام شدند. پیشگویی هر دو مدل از فعالیت ترکیبات مجموعه آزمون به فعالیت واقعی آنها نزدیک بود. به علاوه، کانتورها همراه با نتایج الحاق مولکولی اطلاعات خوبی در راستای فهم خواص موثر بر فعالیت زیستی پیشنهاد کردند. سرانجام، مدل کومفا و کانتورهای آن برای طراحی بازدارنده های جدید و قوی مورد استفاده قرار گرفتند، همچنین مطالعاتTEMDA ocilis ni بر روی ترکیبات طراحی شده صورت گرفت که نتایج تقریبا در توافق با دامنه های استاندارد بودند. در مطالعه دوم، مدل های کومفا و کومسیا برای گروهی از (N (E-آریل-2-اتن-سولفونامیدها به عنوان عوامل ضدسرطان پروستات تولید شدند. آنالیز پتانسیلی گریدی خودکار، APGotuA، که یک روش جدید کیوسار سه بعدی با روش برخط کردن فارماکوفوری است برای این گروه از ترکیبات ساخته شد. مدل کیوسار سه بعدی APGotuA پارامترهای پیشگویی بهتری در مقایسه با کومفا و کومسیا نشان داد. غربالگری مجازی براساس مدلسازی فارماکوفوری و الحاق مولکولی برای تشخیص بازدارنده های جدید از مجموعه داده CNIZ انجام شد و در نهایت، مطالعات TEMDA بر روی بازدارنده های جدید پیشنهاد شده حاصل از غربالگری مجازی صورت گرفت.
Text of Note
3D quatitative structure activity relationship )3D-QSAR(, molecular docking, virtual screening and ADMET studies have been carried out on 2 series of tubulin polymerization inhibitors to predict biological activity of molecules and propose new acticve compounds. In First study, comparative molecular field analysis )CoMFA( and comparative molecular similarity indices analysis )CoMSIA( and docking studies of ortho-aryl chalcones derivatives with anticancer activity against human colon cancer cell line have been carried out. Both models predicted activities of test set in agree to their experimental activities. Moreover, contour maps of models along with the docking results offered enough information to understand the structural features which influence on the biological activity. Finally, the resulting CoMFA contour maps and the corresponding model were used to design new and potent inhibitors. In silico ADMET studies were also performed on designed compounds that results approximately were in compliance with the standard ranges. In second study, CoMFA and CoMSIA methods were performed on a set of )E(-N-Aryl-2-ethene-sulfonamide analogues as microtubule targeted anti-prostate cancer agents. Automated grid potential analysis, AutoGPA module as a new 3D-QSAR approach with the pharmacophore based alignment was carried out on the same dataset. AutoGPA-based 3D-QSAR model had better prediction parameters than CoMFA and CoMSIA. Virtual screening was performed based on pharmacophore modeling and molecular docking to identify the new inhibitors from ZINC database. ADMET studies were performed on compounds retrieved from virtual screening.